陰道超音波檢查是用一個細長的探頭深入陰道，所以不適合無性經驗的女性。能近距離取得子宮、卵巢精確影像，超音波檢查前也不必漲尿，反而要排空尿液，影像會更清晰，包括卵巢濾泡大小和生長、卵巢瘤、子宮內膜厚度（子宮腺肌症）、早期懷孕（6週以內）等腹部超音波檢查看不清楚的部分，都能仔細觀察。
因為超音波檢查能有效觀察卵巢狀況，陰道超音波檢查被認為是輔助診斷卵巢癌的利器，也可以合併CA-125提高診斷率。但到目前為止，卵巢癌仍然沒有適合大規模篩檢的有效方法，高危險群女性（有家族史、未曾生育、卵巢巧克力囊腫、乳癌或子宮內膜癌病史等）在定期抹片檢查時或許可以同時做陰道超音波檢查，掌握卵巢的健康狀況。
做陰道超音波檢查不一定要避開經期，例如經期正好是不孕症患者計算卵巢濾泡數目的好時機，所以別擔心，醫師會建議妳該何時安排超音波檢查。不適合做陰道超音波檢查的情況是：沒有性經驗的女性，或更年期女性因為陰道乾澀萎縮，也容易疼痛、不舒服。
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